穴盤育苗的特點是每一株幼苗都擁有獨立的空間，水分養分互不競爭，幼苗的根系完整，移植后的成活率接近100%，移植后的生長發育快速整齊,商品率高。因此，穴盤育苗在花卉育苗上的應用是一种新的發展趨勢。
花卉种子小、价格高是花卉生產中一個突出問題。因為种子小，往往造成幼苗階段生長緩慢且嬌嫩，苗期時間過長，成苗率低﹔种子价格高，導致成本高，影響生產的收益，給花卉企業帶來損失和風險。采用穴盤育苗方式，可以大大提高花卉育苗的發芽率和整齊度，縮短培育時間，提高花卉的商品价格和商品率。尤其對使用小粒种子育苗的盆花和花壇苗來說，無疑是一次很重要的技術進步。
四個階段
美國的戴維•柯瑞恩（Davidkoranski）將穴盤育苗的生育期分為四個階段。之所以將育苗划分為四個階段是因為這四個階段的生長狀態与所需要的溫度、濕度（相對濕度）、光照、肥料等環境和管理條件各有區別。這四個階段的管理好不好，不僅對幼苗期的發育而且對花卉的形狀、開花數量、生產周期都有很大影響。如瓜葉菊，如果溫度在第二階段超過28℃，則很容易造成胚軸過于伸長，极容易倒伏。而四季海棠如果第二、三階段不能及時施肥的話，以后施肥也會造成生長遲緩一個多月。
第一階段從播种到种子初生根（胚根）突出种皮為止，即所謂的“發芽”期。發芽期最主要的特征是需要較高的溫度和濕度。較高的溫度是相對于以后三個階段來說的。种子發芽所需要的溫度一般在21℃∼28℃之間，大部分在24℃∼25℃為最适溫度，持續恒定的溫度對种子來說可以促進种子對水分的吸收，解除休眠，激活生命活力。較高的濕度可以滿足种子對水分的需要，首先，軟化种皮，增加透性，為种胚的發育提供必需的氧气﹔其次作為种子生化反應的溶劑，促進其生物化學反應的完成，由一种新的生命形式替代潛在的生命狀態。
第二階段种子發芽以后，緊接著是下胚軸伸長，頂芽突破基質，上胚軸伸長，子葉展開，根系、莖干及子葉開始進入發育狀態。這一階段稱為第二階段。第二階段的管理重點是下胚軸的矮化及促壯。如果下胚軸伸長過快，就會引起幼苗徒長。要想促壯及矮化幼苗的下胚軸，必須嚴格控制栽培環境的各個主導因子，如溫度、濕度、光照等。幼苗子葉展開的下胚軸長度以0.5cm較為理想，1.0cm以上則有徒長的現象。下胚軸若太長，當真葉開始伸展時，隨著真葉的葉面積增大及葉片數目的增多，其机械支撐力量不足，容易發生倒伏現象。當下胚軸太長而形成倒伏之后是無法恢复的，所以下胚軸的矮化及促壯是提高成苗率的關鍵。第三階段主要是真葉的生長和發育。這一階段的管理重點是水分和肥料。水分的管理重點在于維持生育期間的水分平衡，避免基質忽干忽濕，做到在适當的時候給予适量的水分。在人工澆水的條件下，要先觀測基質的干濕程度和蒸發情況，确定澆水的時間和澆水量。在自動噴灌條件下，一天澆水三次，每次給水量約達到基質持水量的60%為宜。澆水時間分別為8點、11點及14∼15點之間。16點之后若幼苗無萎蔫現象，則不必澆水。降低夜間濕度，減緩莖節的伸長，矮化幼苗是管理追求的目標。
進入第三階段的幼苗要開始施肥。最始肥料的濃度為2500∼3000倍（或100∼150ppm）足夠，當最初的兩片真葉完全展開之后，肥料濃度增加到2000倍。肥料氮、磷、鉀的比例選擇氮含量較低的配方（N︰P︰K=15︰10︰30），以減少葉面積的快速生長，降低其蒸騰作用。營養過量，除了容易造成徒長弱苗之外，基質的電導率增加，根系的正常發育也會受到影響。
第四階段幼苗生長到3∼4片真葉時，也就到了第四階段。此階段的幼苗准備進行移植或出售。移植前要适當控水施肥，以不發生萎蔫和不影響其正常發育即可。
物質條件
穴盤和基質是穴盤育苗必備的物質條件。基質的种類很多，為适應不同的卉育苗的需要，基質的配比也有所區別。一般原則是种子越小，需要的基質越細。基質的主要組成有草炭土（CSP）、椰糠、珍珠岩、蛭石等。基質的基本要求是無菌、無虫卵、無雜物及雜草种子，有良好的保水性和透气性，pH值5.5∼6.5，EC值低于0.75mmhos/cm3。生產中常將草炭和珍珠岩（或蛭石）以(3∼3.5)︰1的比例混合。育苗基質原則上是新基質，不使用舊的材料，即使如此，在播种前最好也用600∼1000倍液的多菌靈或百菌清消一次毒。
穴盤的穴格及形狀与幼苗根系的生育息息相關，穴格体積大，基質容量大，其水分、養分蓄積量大，對供給幼苗水分的調節能力也大﹔另外，相對地還可以提高通透性，對根系的發育也較為有利。但穴格越大，穴盤單位面積內的穴格數目越少，影響單位面積的產量，价格或成本會增加。穴盤的規格有288目、200目、128目或50目，主要視育苗時間的長短、根系深淺和商品苗（移植苗）的規格來确定。對使用過的穴盤，再次使用前必須消毒，常用方法是600倍液多菌靈，800∼1000倍液殺滅爾等殺菌劑洗刷或噴洒，之后用清水沖洗2∼3次。
將混合好的基質填裝穴盤，可机械操作，也可人工填裝。注意盡量使每個穴孔填裝均勻，并輕輕鎮壓，使基質中間略低于四周。基質不可填裝過滿，應略低于穴盤孔的高度，使每個穴孔的輪廓清晰可見。播种前一天應淋濕基質，達到剛好澆透的程度，即穴孔底部有水滲出的程度。淋濕的方法采用自動間歇噴水或手工多遍噴水的方式，讓水分緩慢滲透基質。
穴盤育苗一般是每個穴孔放一粒种子，無論是机械播种還是人工播种都要力求种子落在穴孔正中。播种后較大粒种子要覆一層基質（蛭石等），小粒种子可不覆土。
環境控制
穴盤育苗需要在一定的環境條件下完成，如溫度、濕度（澆水）、光照、肥料等。如是嚴格地按照戴維的方法，最好在專門的育苗室（發芽室）內進行，借助各种控制條件和檢測儀器使其在標准狀態發芽、發育。對于大型、專業化的生產企業來說，也确實需要這樣的育苗室（發芽室）。對于一般的生產企業來說，也需要有可調溫的溫室，這樣可以滿足各种目標花期的需要。
溫度溫度是決定育苗的首要環境條件。當溫室的溫度低于發芽溫度時需要進行加熱，加熱方式有空气加熱和基質加熱，空气加熱如燃油暖風机加熱、水暖管道加熱等﹔基質加熱如地熱線加熱等。如溫室內溫度太高，可選濕帘風机降溫系統進行降溫，如果溫度差別在2℃∼3℃范圍內可使用溫室的其它系統如遮蔭、通風、噴霧等系統和裝置幫助降溫，這樣可以節約生產成本。但最大的問題是，從第一階段到第四階段是溫度下降的要求，如果背离了季節的變化、光靠強制性的溫度調節的話，容易造成成本上升，所以一定要根据季節的變化合理安排生產。
濕度合理的濕度和适當的噴淋措施是培育健壯花苗的關鍵，從相對濕度接近100%的第一階段，到基質見干見濕、只要不出現萎蔫現象就盡量少澆水的第四階段，也決定了濕度和水分的管理是一個复雜的過程。正确地把握幼苗生產的四個階段并逐步減少基質的含水量是一項重要的管理內容，及時調整自動噴淋（霧）的次數和時間就能控制濕度和水分。蒸發量小，空气濕度大時少噴水，相反，就要多噴水，下午噴最后一遍水時要保証夜間葉面無水珠。
